«Новгородский исторический сборник» учрежден в 1936 году. На его страницах публикуются исследования и материалы по истории и культуре Великого Новгорода и Новгородской земли XII-XXI вв.
До 1940 г. в свет вышло 7 выпусков (Вып. 1. Л., 1936; Вып. 2. Л., 1937; Вып. 3-4. Новгород, 1938; Вып. 5. Л., Новгород, 1939; Вып. 6. Новгород, 1939; Вып. 7. Новгород, 1940; Вып. 8. Новгород, 1940). Выпуски 1 и 2 вышли под грифами АН СССР и Новгородских государственных музеев, последующие довоенные выпуски осуществлялись Новгородской секцией Института истории АН СССР. Все довоенные выпуски выходили под редакцией академика Б.Д.Грекова. Рукопись 9-го выпуска, подготовленная к набору, была утрачена в связи с начавшейся Великой Отечественной войной.
В 1959-1960 гг. была предпринята попытка возродить издание сборника. Вышло в свет два выпуска (Вып. 9. Новгород, 1959; Вып. 10. Новгород, 1961). Первый из них вышел под грифом Новгородского музея-заповедника, второй совместно музея и Ленинградского отделения Института истории СССР АН СССР. Оба выпуска вышли под редакцией Д.С.Лихачева.
В 1982 г. по инициативе и под редакцией академика В.Л.Янина издание было возобновлено и выходило под грифом ЛОИИ СССР АН СССР, а затем Санкт-Петербургского филиала Института российской истории РАН и Санкт-Петербургского Института истории РАН. Двойная нумерация означает новый этап издания (первая цифра) и продолжение предшествующей серии (вторая цифра) .